详情

基于深度学习的腺样囊性癌融合基因异常预测模型构建

申报人:夏荣辉 申报日期:2022-10-05

基本情况

2023医学院第十七期大创项目
基于深度学习的腺样囊性癌融合基因异常预测模型构建
创新训练项目
医学
口腔医学类
工学
计算机类
医+X交叉学科项目
医学院
夏荣辉
指导教师
登录状态下查看

1. 上海交通大学医学院附属第九人民医院,“精才培育计划”

2. 上海交通大学医学院附属第九人民医院,首届院内在职博士后项目

3. 国家自然科学基金青年项目:基于LAMB1调控细胞外基质重塑诠释唾液腺腺样囊性癌转移分子机制研究

1.提供深度学习所需腺样囊性癌病例组织学扫描图片

2.提供深度学习所需腺样囊性癌病例融合基因检测数据

3.提供本课题研究所需场地、耗材

4.全程指导课题研究开展

5.提供项目所需经费

    腺样囊性癌是头颈部唾液腺最常见的恶性肿瘤,其发生与融合基因异常存在显著相关性,具体表现为,约70%的腺样囊性癌具有MYB-NFIB融合基因改变,约15%的腺样囊性癌具有MYBL1-NFIB融合基因改变。融合基因异常是腺样囊性癌发生的驱动因素,本项目拟基于深度学习腺样囊性癌组织学图像,与其基因改变数据结合,构建腺样囊性癌融合基因改变的预测模型。

    目前已开展的工作包括:腺样囊性癌样本收集(约1000例),融合基因检测,组织学图像扫描等。

    预期需要开展的工作:融合基因检测,数据分析,图像学习,模型初步构建。

口腔医学专业不限年级学生2-3

计算机科学与技术专业不限年级学生1-2

选题成员

1

指导教师

序号 教师姓名 电子邮箱 所属学院
1 夏荣辉 登录状态下查看 医学院 第一指导教师

选题附件

结束