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视网膜母细胞瘤表观遗传调控机制研究

申报人:贾仁兵 申报日期:2022-10-31

基本情况

2023医学院第十七期大创项目
视网膜母细胞瘤表观遗传调控机制研究
创新训练项目
医学
临床医学类
医学
临床医学类
重点领域项目
医学院
贾仁兵
指导教师
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1. 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 82073889, 伊利司莫通过调控Hippo/YAP通路影响葡萄膜黑色素瘤生长及转移的作用机制, 2021-01-01 至 2024-12-31, 55万元, 在研, 主持
2. 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 81770961, BMP9在眼眶静脉畸形发生中的作用及其机制研究, 2018-01-01 至 2021-12-31, 56万元, 结题, 主持
3. 上海市科委, 基础研究重点项目, 19JC1410202, 眼眶神经纤维瘤遗传早现发病机制及基于关键蛋白大分子结构解析的靶向治疗研究, 2019-11 至 2022-10, 300万元, 在研, 主持
进行全程的课题指导。

项目设想:  

         视网膜母细胞瘤(Retinoblastoma, RB) 是儿童最常见的眼内恶性肿瘤,可致盲、致残、甚至致死。 我国每年新发病例占全世界 20%,发病人数居世界首位。 RB 好发于 3 岁以下婴幼儿,约 1/3 患儿可遗传,遗传型患儿子代发病风险近 50%, 几乎全部累及双眼。 我国患儿家长就诊意识较为薄弱,对疾病认识不足,导致我国RB晚期患儿比例高,病情重, 死亡率13%,眼球摘除率达42%,致盲率更是居高不下 。 因此, 深入揭示 RB 发病机制, 寻找 RB 有效治疗靶点,降低 RB死亡率, 是亟待解决的临床难题。 目前 RB存在的瓶颈问题主要包括:传统 RB1 基因突变理论无法解释有些患儿并不存在经典遗传学突变, 发病机制研究存在盲区; RB 患儿病情复杂, 即使同样具有 RB1 基因突变的患儿, 临床表现仍然差异巨大, 对 RB 演进规律和肿瘤异质性认识不足。这些结果提示,非 RB1 突变的表观遗传调控在其中起着重要作用。

         针对上述问题,本研究拟从表观遗传学研究重点切入,联合多组学分析方法,绘制 RB 单细胞异质性特征, 揭示演进指纹图谱。进一步, 分析鉴定上述研究筛选的表观遗传靶点在肿瘤耐药、 转移和生长过程中的功能。机制上,利用组蛋白化学修饰研究组学及表观遗传相关研究平台,深度解析表观遗传学的分子调控机制。在上述基础上,开展靶向关键蛋白分子的高通量药筛和干预研究,为 RB诊断及治疗新方法的研究开展提供理论依据。

项目现有基础:

        指导老师团队已开展前期研究, 部分完成RB表观遗传指纹图谱的建立,并以此为基础开展多组学测绘, 多角度展现 RB 进展中的分子变化:利用表观遗传研究平台以及高通量染色体构象捕获手段,绘制了 RB 多组学表观遗传指纹图谱; 完成代谢组学测绘, 展示肿瘤进展与关键调控因子功能;完成10例 RB 组织的单细胞测序,建立了RB 细胞恶性程度进展轨迹及其差异基因表达曲线,对沿轨迹上调的差异基因进行了聚类分析。另外,我们发现多种表观因子所在染色体区域构象异常开放激活; 在RB 临床标本中, EZH2 等表观因子显著高表达,并与肿瘤分期和不良预后相关;在体外实验中,它能够促进 RB 细胞增殖和迁移,同时, 这些表观因子可作为代谢驱动因子,促进致癌代谢物乳酸的产生增加,引起组蛋白乳酸酰化水平增高。

预期需要开展工作:

1. 统合表观遗传与遗传学理论,揭示其内在联系,分析其在 RB 发生、 代谢、免疫及进展中的联系。 汇总表观指纹图谱与空间转录组为核心的遗传信息, 结合代谢组学,利用自动量化肿瘤发生与转移情况的深度学习系统,进行数据有机统合及自动量化分析。

2. 探索其内在分子调控机制,丰富表观遗传调控分子互作模式与机制。 针对多种很可能相互关联的表观遗传因素, 聚焦探索 “表观遗传-遗传”分子互作模式。机制探索过程中, 利用高通量代谢组学, 绘制进展期 RB 特异性表观遗传-代谢图谱, 联合表观因子敲除后代谢组学测序分析,进一步筛选表观因子引起的异常代谢产物, 分析其导致的组蛋白化学修饰异常, 揭示肿瘤细胞内小分子代谢异常和协同代谢变化;明确协同调控因子在 RB 发生、代谢、免疫调控等环节的功能。

3. 在国家转化医学研究院(上海)新药筛选中心,利用 FDA 和 NMPA批准的小分子药库,筛选能够显著影响表观遗传因子活性的小分子药物。联合人工智能虚拟药筛手段,利用药物-蛋白结构自动匹配、 分子对接等方法, 建立药物-蛋白互作界面高分辨模型。利用裸鼠原位成瘤模型进行候选小分子药物体内杀伤作用验证。

拟招募临床医学(八年制法语班)专业3人。预防医学专业1人。

选题成员

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指导教师

序号 教师姓名 电子邮箱 所属学院
1 贾仁兵 登录状态下查看 医学院 第一指导教师

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结束