详情

基于多源异构数据和深度学习方法进行抑郁症诊断、亚型分类和疗效预测

申报人:金成 申报日期:2022-03-04

基本情况

第二十五期“上海交通大学大学生创新实践计划”项目
基于多源异构数据和深度学习方法进行抑郁症诊断、亚型分类和疗效预测
创新训练项目
工学
计算机类
创新类
生物医学工程学院
金成
指导教师
登录状态下查看
上海市科委重点研发项目XMR
本研究和国家精神心理疾病临床医学研究中心(依托于北京安定医院)完成。研究组具备医学语言处理技术、医学影像辅助诊断技术、医学知识推理三大主研方向,设置数据挖掘,机器学习,复杂疾病智能诊疗,药物智能发现/设计,智能生物合成等算法分析平台,同时搭建了跨医疗机构联邦学习大数据云计算平台。实验室与斯坦福大学李飞飞教授领导的HAI(Human-Centered Artificial Intelligence)等国际知名医学人工智能研究机构保持着紧密的科研合作关系。具备了此课题的所有技术支撑能力。在硬件方面,实验室拥有自己的超算中心(GPU卡150块),保证了完成此项目的大数据分析,高通量的计算。


目前抑郁症已成为严重的全球性卫生问题,全球有近3亿人罹患抑郁症,近十年来患者增速约18%,它已经成为人类的第二杀手,仅次于癌症2019年发表的中国精神卫生调查显示,成人抑郁症终身患病率高达到3.4%。但抑郁症是一种异质性综合征,以临床症状评估为抑郁症诊断的关键指标并不稳定。困难聚焦在对其发病机制、客观诊断标记和高效治疗这三个重要的临床科学问题的深层求解上。已有多家研究机构联合构建涵盖多个学科层面的综合数据库,为抑郁症的研究提供了重要的信息资源,但针对这种大规模多源异构数据,建模还处于探索阶段,还没有通用且被广泛认可的分析工具,这严重阻碍了对抑郁症病理生理机制的深入研究。本项目组一直致力于开发临床级别的人工智能辅助诊疗评估的系统,着力实现大数据数理科学、多模态信息处理技术、临床疾病智能诊断的三方闭环互通。为此,基于全维度多源异构数据,我们拟提出一种多任务稀疏学习网络框架,开展联合学习,利用时空图神经网络挖掘多类数据之间的重要性、互解释性、互补性,利用张量计算建立任意维度变量间的融合机制,同时使网络轻量化。进一步建立挖掘抑郁症发病机制的因果分析系统,获取客观明确的疾病的量化指标、 解析遗传、行为、生理与疾病的相关关系。经过大规模多中心的独立验证,这种具有共享特性的临床级AI辅助诊疗系统有望获得良好的可解释、鲁棒性和泛化能力,有潜力成为一种抑郁症诊断的通用工具。

课题目标:

. 学习和掌握生物医学大数据清洗与特征表示技术

     1. 数据清洗技术

     2. 数据预处理

       a) 数据结构化; b) 文本变量处理; c) 缺失值处理

     3. 特征筛选

         a) 离散型变量特征筛选;b) 连续性变量特征筛选

. 学习和掌握基于多源异构数据的医学人工智能系统的构建和训练

      1. 非结构化数据处理子模块

         a) 功能网络:图论学习、图卷积神经网络的构建;b) 形态学特征提  

            取:多尺度图像特征表示网络的建立。

       2. 结构化数据处理子模块

         a) LSTM; b) 注意力机制时间序列的Encoder-Decoder体系结构建立

       3. Hybrid Model

         a) 多种神经网络模型的结合;  b) 多种数据类型融合;c) 多维时间

            序列数据挖掘中的相似性度量方法的掌握。

选题成员

1

指导教师

序号 教师姓名 电子邮箱 所属学院
1 金成 登录状态下查看 生物医学工程学院 第一指导教师

选题附件

结束